Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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