Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Spns3Q9D232 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Spns3Q9D232 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Spns3Q9D232 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Spns3Q9D232 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spns3Q9D232 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms