Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms