Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms