Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtpbp8Q9CY28 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtpbp8Q9CY28 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtpbp8Q9CY28 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtpbp8Q9CY28 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtpbp8Q9CY28 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms