Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ifitm3Q9CQW9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ifitm3Q9CQW9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ifitm3Q9CQW9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ifitm3Q9CQW9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms