Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms