Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl41Q9CQN7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms