Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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