Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 421.4 ms