Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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