Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms