Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cep41Q99NF3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms