Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms