Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms