Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hps4Q99KG7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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