Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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