Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms