Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms