Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms