Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smg8Q8VE18 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smg8Q8VE18 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smg8Q8VE18 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Smg8Q8VE18 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg8Q8VE18 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg8Q8VE18 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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