Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms