Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrif1Q8CDD9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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