Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms