Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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