Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim65Q8BFW4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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