Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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