Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms