Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms