Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim37Q6PCX9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trim37Q6PCX9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trim37Q6PCX9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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