Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms