Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms