Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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