Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf1Q64213 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms