Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm1Q61508 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ecm1Q61508 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms