Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms