Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx49Q4FZF3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx49Q4FZF3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms