Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fam220aQ3ZN08 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam220aQ3ZN08 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms