Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

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Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc110Q3V125 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc110Q3V125 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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