Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms