Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Skap2Q3UND0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms