Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms