Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms