Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms