Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms