Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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