Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde12Q3TIU4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms