Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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