Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms