Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms